CB-DOCK 2 DASTURIDA 4-((2-FTORFENOKSI)METIL)-1-(4-NITROFENIL)-1H-1,2,3-TRIAZOLNI MOLEKULYAR DOKING QILISH
DOI:
https://doi.org/10.54613/ku.v15i.1231Keywords:
4-((2-ftorfenoksi)metil)-1-(4-nitrofenil)-1H-1,2,3-triazol, molekulyar doking, ligand, oqsil, CB-DOCK 2.Abstract
Mazkur tadqiqot ishida yangi sintez qilingan 4-((2-ftorfenoksi)metil)-1-(4-nitrofenil)-1H-1,2,3-triazol birikmasining biologik potensiali kompleks nazariy usullar yordamida oʻrganilgan. Dastlab, PASS Online dasturidan foydalanib, qoʻzgʻatilgan birikmaning 10 dan ortiq potentsial farmakologik faollik turlari, jumladan, antikanser, antivirus va yalligʻlanishga qarshi faolliklar boʻyicha bashorat qilindi. Yuqori bashorat qilingan faolliklar asosida ushbu faolliklar bilan bogʻliq boʻlgan maqsadli oqsillar tanlab olindi. Keyingi bosqichda tanlangan har bir oqsil bilan ligand oʻrtasidagi oʻzaro taʼsir CB-DOCK 2 dasturi yordamida molekulyar docking usulida tahli1 qilindi. Docking natijalari asosida ligandning har bir oqsilga bogʻlanish affinligi (bogʻlanish energiyasi), bogʻlanish joyidagi konformatsion oʻzgarishlar va oʻzaro taʼsir qiluvchi aminokislota qoldiqlari aniqlandi. Tadqiqot natijalari nazariy jihatdan koʻrib chiqilgan birikmaning tanlangan patogenetik maqsadli oqsillar, ayniqsa, onkologik markazlar bilan yuqori affinlikda oʻzaro taʼsirlanishi mumkinligini koʻrsatdi, bu esa uni qiziqarli farmakologik nomzod sifatida tasdiqlaydi va keyingi eksperimental tekshirishlar uchun asos yaratadi.
Foydalanilgan adabiyotlar:
1. Liu Y, Grimm M, Dai W-T, Hou M-C, Xiao Z-X and Cao Y. 2019. // CB-Dock: a web server for cavity detection-guided protein–ligand blind docking // Acta Pharmacologica Sinica // vol 41, pp 138–144.
2. Liu Y., Xiaocong Y., Jianhong G., Shuang Ch., Zhi-Xiong X., Yang C. 2022. // CB-Dock2: improved protein–ligand blind docking by integrating cavity detection, docking and homologous template fitting // Nucleic Acids Research // vol 50 (Web Server issue W1), -P. 159-164.
3. Lagunin A., Poroikov V., Stepanchikova A., Filimonov D. 2000. // PASS: Prediction of activity spectra for biologically active substances. // Bioinformatics. Vol. 16 (8). –P. 747–748.
4. Abatov M.A. 2024. // Theoretical study of the biological activity of 1,6-bis(4-bromophenoxy)hexa-2,4-diine. // European Journal of Interdisciplinary Research and Development. ––V.31. –P. 34-38.
5. Lengauer T., Rarey M. 1996. // Computational methods for biomolecular docking. (англ.) // Current Opinion In Structural Biology.–June (vol. 6, no. 3) –P. 402-406.
Published
Iqtiboslik olish
Issue
Section
License
Copyright (c) 2025 QO‘QON UNIVERSITETI XABARNOMASI
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.